El censo del Rione Campo Marzio, realizado en el momento de la plaga de 1656, da su edad como 52 años. Fue organista en San Giovanni in Laterano, Roma, desde 1631 a 1637, y también estuvo activo en San Luigi dei Francesi desde el 25 de agosto de 1633 como intérprete de tiorba. También tocaba el violín. Por lo menos desde 1638 estuvo en el servicio del cardenal Pier María Borghese hasta la muerte de aquel en  junio de 1642.

Entre 1644 y 1649 fue regularmente empleado para organizar la música para el Festival de San Jerónimo en la iglesia de San Girolamo degli Schiavoni. El  censo de 1656 lo describe como un scudiero (escudero) del Papa Alejandro VII. Fue miembro activo de la Congregazione dei Musici di Santa Cecilia, y fue elegido guardiano de los organistas en 1670. 

En 1658 se confió a Boccalino la organización de la música para las celebraciones de Quarant'ore en la capilla Borghese de Santa María Maggiore, y también se sabe que compuso un oratorio, "Tre fanciulli della fornace di Babilonia", cuya música está perdida. Sus obras sobrevivientes son arias seculares y cantatas para una o dos voces y continuo, más cercanas al estilo de Luigi Rossi que al de Carissimi. Un aria fue incluido en "Ariette di musica" de Florido de Silvestris (1646) .