Muy poco es lo que se sabe sobre su vida. Fue nombrado organista de la catedral del Cuzco en Pentecostés de 1611 con un sueldo anual de 300 pesos. El 16 de agosto de 1611 el capítulo de la catedral subió su paga a 450 pesos con la condición de que aceptara continuar en el puesto por cuatro años, tocando diariamente.

Su encantadora chanzoneta de tres partes “Hijos de Eva tributarios” fue copiada en la segunda mitad del siglo XVII en un libro común de 500 páginas “Tesoro de diversas materias” (en Buenos Aires, Museo Ricardo Rojas, manuscrito de Gregorio de Zuola).

Sus dos hijos lo sucedieron en la catedral del Cuzco como organistas principales; el mayor, mencionado como ‘el licenciado Thomas de Herrera, sacerdote’, murió poco antes del 25 de febrero de 1682, y fue sucedido inmediatamente por su hermano menor.